Linux Applications for Science & Engineering

「Linux にはアプリケーションが少ない」とお嘆きのあなた、 そんなことはありません。 もともと Unix には科学・工学用のフリーなアプリケーションが豊富にあります。 しかし、ソースのみで配布されているものも多く、インストールに苦労することもあるようです。

ここでは、メディアラボ が厳選した興味あるアプリケーションを、 LinuxMLD 7、 MLD 6 および MLD 5 用の RPM パッケージを用意して御紹介します (一部のパッケージは LinuxMLD 7 対応は作業中です)。 アプリケーションの機能紹介だけでなく、使い始め方、「はじめの一歩」を解説しています。

ご注意： 御紹介しているアプリケーションはすべて Linux あるいは Unix 用です。Microsoft Windows 用ではありません。 ただしアプリケーションによっては Windows 版や Macintosh 版が用意されている場合もあります。それぞれのアプリケーション配布元の web ページをご覧ください。

最近の更新情報 (微妙な更新は随時 :-)

[2007/01/25]
ごめんなさい。リンク集以外は 2年以上更新していません。 新しい情報はそれぞれの配布元のページを参照していただくよう、お願いいたします。 (配布元サイトが無くなっているものもあったりします...orz)

分野別アプリケーションの御紹介 （→ ABC 順リスト）

• 化学・生物学
  • Atomix -- 分子を組み立てるパズルゲーム
  • chemeq -- 化学反応式を LaTeX コードで出力
  • Chemtool -- 分子構造図を書き FIG や LaTeX, EPS で出力
  • Garlic -- タンパク質構造 (PDB) の可視化
  • GPeriodic -- 元素の周期表 (MLD 6 に収録)
  • IPC -- 化学組成式から同位体による質量スペクトルパターンを計算
  • KUMI -- 分子構造データの Z-matrix エディタ
  • MOPAC7 -- 半経験的分子軌道計算プログラム
  • Open Babel -- さまざまな分子構造ファイル形式を相互に変換
  • XBS -- 分子や結晶をシンプルな ball-and-stick モデルで表示
  • XDrawChem -- 分子構造式を描き、計算化学ソフト用のファイルを出力
  • xmolwt -- 化学組成式から分子量を計算

• 物理学・天文学
  • FeynmanGraph -- Feynman ダイアグラムを描き、PostScript で出力
  • GPS -- 多体問題のシミュレータ (Gravitational Particle Simulator)
  • Light Speed! -- 特殊相対論の効果を視覚化するシミュレータ
  • OpenUniverse -- 太陽系の惑星、衛星を眺めるシミュレータ
  • TPtime -- グレゴリオ暦とユリウス日を相互に変換
  • XEphem -- インタラクティブな天体プラネタリウム
  • XTide -- 調和関数を用いた潮位計算

• 数学
  • Eukleides -- 初等幾何図形を描き TeX に変換できる言語
  • Mxp -- マンデルブロー集合の探索 (Mandelbrot explorer) (MLD 6 に収録)
  • surf -- 代数的な曲面、曲線を描く
  • tkmatrix -- 行列演算の計算プロセスを表示する学習用プログラム
  • Xlife -- 超高速ライフゲーム (セルオートマトン)
  • Yacas -- コンパクトでフレキシブルなコンピュータ代数言語
  
  
  • 関数グラフ
    • geg -- １変数の数学関数をプロット。交点を求めることもできる (MLD 6 に収録)
    • gyapp -- 時間 t を含む数学関数をリアルタイムでプロット

• 数値計算 (統計の項も参照してください)
  • Algae -- 数値解析のためのインタプリタ言語
  • Euler for GTK+ -- グラフィックス、区間演算を備えた数値計算パッケージ
  • Octave -- 行列演算を中心とする数値計算言語 (MLD 5,6,7 に収録)
  • RlaB -- 行列演算を中心とする数値計算言語
  • Scilab -- 制御系設計、 信号処理等に適した数値演算パッケージ
  
  
  • 電卓ソフト
    • bc -- コンソールベースの任意精度電卓 (MLD 5,7 に標準インストール、MLD 6 に収録)
    • Calcoo -- 科学・工学用途に使いやすい電卓 (MLD 6 に収録)
    • cgtkcalc -- 複素数の関数計算ができる GTK+ 電卓
    • GRPN -- 複素数、行列計算もできる RPN (reverse polish notation) 電卓
    • rCalc -- 科学・工学向きの、数式で計算するタイプの電卓

• データの視覚化(プロット)・解析
  • g3data -- グラフから数値データを抽出
  • gnuplot -- 強力なグラフ作成ツール (MLD 5,6,7 に収録)
  • Gri -- PostScript を出力するグラフ作成言語
  • Ngraph -- 理工系のための２次元グラフ作成プログラム
  • RTP -- 標準入力からデータを読み込みリアルタイムにプロット
  • Topaz -- コンソールベースの２次元グラフ生成システム
  • zimg -- テキストファイルやバイナリーファイルから2Dイメージマップを生成

• 統計 (数値計算の項も参照してください)
  • pasu -- 基礎的な確率、統計の計算を行なうツール集
  • R -- 統計解析・グラフィックスのための言語
  • statist -- コンソールベースの統計処理ソフト
  • XLISP-STAT -- グラフ機能も備えた汎用の統計解析ソフト (MLD 5 に収録)

• 電気工学・機械工学・コンピュータ科学
  • FElt -- CAD-like なインターフェースを持つ有限要素法の解析システム
  • genigma -- 第２次世界大戦でドイツが使用した暗号 ENIGMA のシミュレータ
  • Gnome Flow -- 流体の流れをシミュレート
  • gTuring -- チューリングマシンのシミュレータ (MLD 6 に収録)
  • QCad -- シンプルな操作の機械系 2D CAD
  • Sortdemo -- いろいろなソートアルゴリズムのデモを作成
  • TkGate -- ロジック回路の作成、シミュレーション
  • UCBLogo -- バークレー版 Logo インタープリタ
  • XCircuit -- 電子回路図の作成に適した CAD プログラム

• その他
  • gonvert -- 様々な単位を相互に変換するユーティリティ
  • Xfig -- ドロー系(ベクター形式)の描画ツール。日本語対応版 (MLD 6,7 に収録)
  • Xpdf -- シンプルな PDF ビューア (MLD 5 に収録, MLD 6,7 では標準インストール)

• ライブラリ
  • Open Motif -- X11 の GUI ツールキット (MLD 7 に標準インストール)
  • PSTricks -- (La)TeX で直接 PS命令を使って図が描ける TeX パッケージ (MLD 5 の pTeX 用)

お知らせなど

各ページで御用意している RPM パッケージは LinuxMLD 5、6、7 用に rpm バージョン 4 で作成しています。RedHat 7-9 ベースのシステムならば利用できると思いますが、動作確認は LinuxMLD でのみ行なっています ( Linux Science-Pack CD のページ のサポート情報も参照してください)。

その他の情報

• MLD の操作法
  「アプリケーションを使う」という立場から LinuxMLD の操作のヒントをまとめています。
  • CD-ROM のマウント
  • RPM パッケージのインストール
  • ドキュメントはどこに？
  • Unix の基礎(リンク集) (2002/11/29 更新)

リンク集

• アプリケーション情報 (2008/02/15 更新)
• 科学・工学に関する情報 (2008/02/15 更新)

• (番外編) Puzzle の楽しみ (2008/02/15 更新)

今後も少しづつ充実させて行きたいと思います。 御意見、御要望をお待ちしています。